A. 預制凝膠法
1. 將GelRed（10,000X）原液以1:10,000比例加入到熔化的凝膠中，混合均勻。（GelRed可在加熱后的凝膠冷卻至45℃左右時添加。）
2. 倒膠，室溫放置等待凝固。
3. 按常規方法上樣電泳。
4. 觀察染色凝膠使用標準的透照儀(302或312 nm)，成像使用溴化乙錠濾光器，SYBR或GelStar濾光器凝膠成像也可以得到很好的結果。
5. 未使用的含有GelRed的預制凝膠可以重新熔化做膠，為保證最佳熒光信號，酌情添加適量染料。不建議長期儲存含有GelRed熔化形式的瓊脂糖。含有GelRed的預制膠可以保存在4℃供下次使用

B. 泡染法

1. 按照常規方法進行凝膠電泳。

2. 稀釋 GelRed ：用水將10,000X儲備液稀釋3300倍制成3X染色液。通常情況下50mL染色液足夠染一小塊凝膠。（注：染色液中含有0.1 M NaCl能增強靈敏度，但可能會促使凝膠染色出現沉淀。）

3. 把凝膠放于合適的容器，如聚丙烯染色托盤中。添加足量的3X染色液至浸沒凝膠。

4. 室溫緩慢振蕩染色30min。注：最佳染色時間根據凝膠厚度以及瓊脂糖濃度不同略有不同。對于含3.5-10%丙烯酰胺的凝膠，染色時間通常介于30min至1h，并隨丙烯酰胺含量增加而延長。

5. 不必脫色，必要的話可以水洗以降低背景值。

6. 使用標準的透照儀(302或312 nm)觀察染色凝膠，成像使用溴化乙錠濾光器，SYBR 或 GelStar濾光器凝膠成像也可以得到很好的結果。