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DNA提取試劑盒的保存與操作方法
  • 發布日期:2022-07-19      瀏覽次數:1688
    • DNA提取試劑盒是根據氯.化芐法構建的,能夠從樣本中提取基因組DNA的試劑盒。氯.化芐具有能將含有纖維素等的細胞壁中的羥基芐基化,從而破壞細胞壁的特性。本制品利用了氯.化芐的這一特性,將植物樣品凍結融解后,再使用Pipet Tip的尖.端將植物樣品在Microtube壁上數次按壓即可破壞細胞壁。本法與傳統方法相比,省去了液氮研磨等煩瑣步驟,有利于一次性處理大量樣品。而且,本制品經過了改良,熱處理時間只需15分鐘,使用本制品從實驗開始至水相回收只需30分鐘時間。得到的基因組DNA可以進行PCR擴增及限制酶處理等。

            保存方法

      室溫。低溫保存可能會有沉淀析出。如果發生析出現象,請于50℃溶解后,再于室溫保存。

      操作方法

      全套操作約需1小時,分勻漿、細胞裂解、除蛋白、DNA純化等步驟,詳細說明如下。

      勻漿和細胞裂解:

      使用不同的實驗材料需采用不同的勻漿步驟,具體說明如下:

      【從動物組織中提取基因組DNA】

      使用研缽進行勻漿時:

      ① 取1~100 mg的動物組織或人組織移入冰浴預冷的研缽中,快速用力展研成勻漿。

      注)下列組織請加液氮研磨至粉末狀。

      A.富含DNA酶的胰臟、脾臟、胸腺、淋巴等組織。

      B.富含膠原蛋白的皮膚、肌腱等組織。

      C.富含角質蛋白的組織或堅硬的組織(如骨骼)等。

      ② 加入650 μl的Solution A和0.9 μl的RNase A1,溫和研磨30秒鐘。

      注)使用上述①-注)的實驗材料時,請在加入Solution A及RNase A1后,將研缽置于65℃水浴上研磨1分鐘。

      ③ 收集650 μl研磨好的組織勻漿液移至Collection Tube中。如果勻漿體積不足650 μl,請補充Solution A至650 μl,65℃保溫5分鐘。

      使用研磨棒進行勻漿時:

      ① 取1~100 mg的動物組織或人組織移入冰浴預冷的Collection Tube 中,用研磨棒快速研磨成糊狀。

      ② 加入350 μl的Solution A和0.9 μl的RNase A1后用研磨棒快速研磨成勻漿。

      ③ 加入350 μl的Solution A將研磨棒上的勻漿沖入Collection Tube中,充分振蕩混合后,65℃保溫5分鐘。

      【從植物材料或植物培養細胞中提取基因組DNA】

      ① 按下表稱取適量的新鮮植物材料(如選用的是冷凍干燥植物材料,則用量減半),剪成小塊放入研缽中,加入液氮,待樣品冷凍*后快速、用力研磨至粉末狀。研磨時應間斷加入液氮以防止材料融化。

      植物材料種類

      植物材料使用量*

      植物花、葉片

      10~100 mg

      植物莖

      60~240 mg

      植物根

      80~240 mg

      植物種子

      80~240 mg

      * 如選取植物的根、種子等樣品時,因其基因組DNA含量很低,需使用超過表格中所示的參數用量,此時請分兩管進行步驟1~6的實驗操作,在步驟7的操作中再將各管溶液分次加入至同一Spin Column中過濾,使各管的基因組DNA結合到同一個Spin Column上。

      如從培養的植物細胞中提取基因組DNA,請離心收集2×103~1×107的培養植物細胞,加入150 μl水充分懸浮細胞后移入研缽中,加入液氮后快速、用力研磨至粉末狀。

      注)樣品研磨應充分,否則將會嚴重影響基因組DNA的收率。

      ② 將研缽移至65℃水浴,當樣品粉末剛開始融化時,向研缽中加入700 μl的Solution A和1.2 μl的RNase A1,用力碾磨30秒。

      ③ 收集650 μl研磨好的組織勻漿移至Collection Tube中。如勻漿體積不足650 μl,請補充Solution A至650 μl。65℃保溫15分鐘。

      注)處理富含纖維的根/莖等植物材料或富含淀粉、蛋白質的種子等時,可延長水浴時間至60分鐘。

      【從全血中提取基因組DNA】

      ① 取10~250 μl的全血(含抗凝劑)加入至Collection Tube中。

      ② 加入500 μl的Solution A。

      ③ 加入1 μl的RNase A1,激烈振蕩15秒鐘后,冰浴5分鐘。

      注) 人與動物的抗凝全血的一次處理量為≤250 μl;禽類、兩棲類的抗凝全血的一次處理量為≤10 μl。

      【從培養細胞中提取基因組DNA】

      三.使用懸浮培養的動物細胞時:

      ① 使用Collection Tube收集1×105~1.5×107的細胞懸浮液,5,000 rpm離心5分鐘,棄上清(細胞培養液)。

      ② 加入150 μl的滅菌蒸餾水或PBS懸浮細胞。

      ③ 加入500 μl的Solution A和0.8 μl的RNase A1,激烈振蕩15秒鐘,然后室溫靜置1分鐘。

      四.使用貼壁細胞時:

      ① 棄盡培養液,向培養皿中加入650 μl的Solution A,室溫靜置1分鐘。

      注)96孔板等的每個孔中一次容納不了650 μl 溶液時,請分數次處理細胞。

      ② 用移液槍的槍頭吹落貼壁培養細胞,取650 μl的細胞懸浮液轉移至Collection Tube中。

      ③ 加入0.8 μl的RNase A1,激烈振蕩15秒鐘,然后室溫靜置1分鐘。

      2. 加入400 μl的Solution B,振蕩混合。

      3. 加入1 ml的4℃預冷的Solution C,充分混勻后,12,000 rpm離心2分鐘。

      4. 棄去上層有機相,再加入1 ml的4℃預冷的Solution C,充分混勻后,12,000 rpm離心2分鐘。

      5. 棄去上層有機相,然后將水相溶液(無色下層)轉移至置于Collection Tube上的Filter Cup中,12,000 rpm離心1分鐘。

      注)有機相(上層)帶有顏色,請務必除盡,否則會阻礙DNA結合到DNA制備膜上。相間沉淀不必考慮,在過濾時將被去除。

      6. 棄Filter Cup,在濾液中加入400 μl的DB Buffer,混合均勻。

      7. 將試劑盒中的Spin Column安置于Collection Tube上。將上述操作6混合溶液轉移至Spin Column中,12,000 rpm離心1分鐘,棄濾液。

      8. 將500 μl的Rinse A加入至Spin Column中,12,000 rpm離心30秒鐘,棄濾液。

      9. 將700 μl的Rinse B加入至Spin Column中,12,000 rpm離心30秒鐘,棄濾液。

      注)請沿Spin Column管壁四周加入Rinse B,這樣有助于*沖洗沾附于管壁上的鹽份。

      10. 重復操作步驟9。

      11. 將Spin Column安置于新的1.5 ml的離心管上,在Spin Column膜的中央處加入50~200 μl的滅菌蒸餾水或Elution Buffer,室溫靜置1分鐘。

      注)把滅菌蒸餾水或Elution Buffer加熱至65℃使用時有利于提高洗脫效率。

      12. 12, 000 rpm離心1分鐘洗脫DNA。

      如果實驗室備有適合于Spin Column接口的負壓裝置,可從上述操作步驟6完成以后進行以下操作。

      7. 將試劑盒中的Spin Column插到負壓裝置的插口上,將上述操作步驟6的混合溶液轉移到Spin Column中,開啟調節負壓裝置,緩慢吸走Spin Column中的溶液(流速控制在1滴/秒)。

      8. 將負壓調至最大,向Spin Column中加入500 μl的Rinse A,吸盡Spin Column中溶液。

      9. 向Spin Column中加入700 μl的Rinse B,吸盡Spin Column中溶液。

      注)請沿Spin Column管壁四周加入Rinse B,這樣有助于*沖洗沾附于管壁上的鹽份。

      10. 重復操作步驟9。然后從負壓裝置上取下Spin Column,將其安置于試劑盒中的Collection Tube上,12, 000 rpm離心1分鐘。

      11. 將Spin Column安置于新的1.5 ml的離心管上,在Spin Column膜的中央處加入50~200 μl的滅菌蒸餾水或Elution Buffer,室溫靜置1分鐘。

      注)把滅菌蒸餾水或Elution Buffer加熱至65℃使用時有利于提高洗脫效率。

      12. 12, 000 rpm離心1分鐘洗脫DNA。

            分類

      DNA提取試劑盒主要可以分為以下幾大類:小量全血基因組DNA提取試劑盒、中量全血基因組DNA提取試劑盒、組織/細胞基因組DNA提取試劑盒、中量/大量組織/細胞基因組DNA提取試劑盒、全血/組織/細胞基因組DNA提取試劑盒、CTAB植物基因DNA提取試劑盒、新型植物基因組DNA提取試劑盒、酵母基因組DNA提取試劑盒、M13噬菌體單鏈基因組DNA提取試劑盒。

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